Amatőrfilmesként kezdte pályáját, majd a Balázs Béla Stúdióban készített filmek után film- és televízió rendezői diplomát szerzett a Színház- és Filmművészeti Egyetemen. Ezüstkor (1994) című főiskolás munkája moziforgalmazásba került, Észak, Észak (1999) című filmje elnyerte a Kritikusok Legjobb Elsőfilm díját, Iszka utazása (2007) című alkotása pedig a 38. Magyar Filmszemle Fődíját. A Berlinale bemutatót követően a filmet közel száz fesztivál tűzte műsorára, az Európai Parlament Lux Díjának nevezésén bekerült 2007 tíz legjobb európai filmjébe.

Bollók Csaba 2001-ben Balázs Béla-díjat, 2007-ben Reykjavikban az "Év Európai Felfedezettje" díját kapta. 2009-ben Magyarországot képviselte az Academy Award "Legjobb Idegennyelvű Film" versenyében. Az egri Eszterházy Károly Főiskola és a prágai Midpoint Central-European Script Center tanára. Jelenleg a Nap titkai (Sophie and the Secrets of the Sun) című nemzetközi filmtervén dolgozik.